医院设有34个临床科室，10个医技科室，14个行政职能科室。心血管内科、消化内科被遴选为国家级重点建设专科，现有自治区级重点建设专科6个，成功创建市级重点专科16个，成功备案自治区临床医学研究中心5个。创建了国家级标准版胸痛中心，自治区级综合卒中中心、自治区Ⅱ级创伤中心及市级危重新生儿救治中心、危重孕产妇救治中心。